Takım İlişkileri
Uchiha Sasuke ile nefretle başlayan bir ilişkileri vardır. Bundaki ana sebep Sasuke'nin okulun birincisi ve karizmatik oluşu sebebiyle herkesin Naruto yerine Sasuke ile ilgilenmesidir. Ayrıca Naruto'nun aşkı Sakura'nın Sasuke'ye aşık olması Naruto'nun Sasuke'den iyice nefret etmesine sebep olmuştur.Ancak aradaki bu nefret naruto ve sasuke nin güçlenmesine fayda sağlayacaktır.zaman geçtikçe bu nefret -dışarıdan çok iyi bir şekilde görülemese de- çok sıkı bir arkadaşlığa dönüşmüştür. Fakat birbirlerine kendilerini kanıtlamak adına Konoha hastanesinin çatısında dövüşe başlamıştır. Bu dövüş büyük zararlar vermeden Kakashi tarafından durdurulmuştur. Fakat bu dövüş sonrasında sınıfın en kötü öğrencisi Naruto'nun bile Sasuke'den daha güçlü olduğu Sasuke tarafından görülmüş ve Sasuke özgüvenini iyice kaybetmiştir.
Sasuke'nin hayattaki amacı onu güçlü kalmaya sevketmiştir. Sasuke babası tarafından ağabeyi Itachi ile hep karşılaştırılmış ve hor görülmüştür. Uchiha Itachi, tüm klanını sadece gücünü ispatlamak adına öldürmesi sebebiyle Naruto gibi yalnız büyümüştür ve abisini durduramadığı için kendisini suçlamaktadır. Artık tek hedefi abisini bulup intikam almaktır, ancak Itachi Uchiha klanının özel yeteneği Şaringan'ın en üst seviyesi Mangekyo Şaringan'a sahiptir ve bunu en yakın arkadaşını öldürerek kazanabilmiştir. Sasuke, abisinden intikam almak adına 3. Hokage'nin öğrencileri "3 Sannin"den en tehlikeli olanı olan Orochimaru'ya gidip onunla beraber kendini çalıştırmak istemiştir. Sasuke'yi Orochimaru'ya teslim etmeye çalışan Orochimaru'nun adamları Ses Dörtlüsü yol ortasında Uzumaki Naruto, Akimichi Chouji, Nara Shikamaru, Hyuuga Neji, Inuzuka Kiba, o sırada bir hastalıkla baş etmeye çalışan Rock Lee ve sonradan yardıma gelen Sunagakure ninjaları (Gaara, Temari ve Kankurou) tarafından durdurulmuştur fakat Sasuke, Ses Dörtlüsü'nün Sasuke'ye verdiği bir hap sayesine Çuunin sınavları sırasında Orochimaru'nun Sasuke'nin boynunu ısırarak ona verdiği "Lanetli Mühür"ünü güçlendirmiştir. Bu güçle beraber başkalarının yardımı olmadan Orochimaru'ya gitmek isteyen Sasuke, Naruto tarafından durdurulmuştur. Bu dövüş sırasında Sasuke, Naruto'ya "Sen benim en iyi arkadaşımsın" demiştir. Abisi Uciha Itachi, Mangekyo Şaringana ulaşmasının yolunun en iyi arkadaşını öldürmek olduğunu söylemiştir daha önce. Ancak Sasuke, bu güce abisinin istediği şekilde değil de kendi yöntemiyle ulaşmak istediği için Naruto'yu öldürmemiştir ama Naruto'yu yenip Orochimaru'ya gitmeyi başarmıştır.
Bu sırada, Orochimaru'nun Sasuke'yi istemesinin tek sebebi ruh transferi tekniği ile Sasuke'nin Şaringan yeteneğine sahip bedenini ele geçirmektir. Bu teknik yapıldıktan sonra tekrarlanabilmesi için 3 yıl geçmesi gerekmektedir ve son seferden beri 2 yıl geçmiştir. Naruto'da Sasuke'yi bu transfer gerçekleşmeden kurtarmak için çalışmaktadır. Fakat Naruto'ya bir zaman zarfından sonra pek de gerek kalmayacaktır. Çünkü Sasuke Orochimaru için bile çok güçlü hale gelmiştir.
Naruto'nun da içinde bulunduğu Takım 7'nin Jounin (Üst seviye ninja) seviyesindeki öğretmenidir. Kakashi, ilk başlarda Naruto'ya (ve takımın geri kalanına) karşı soğuk ve ürkütücü bir tutum sergilemiştir. Ama geçen zaman süreci sonucunda aradaki bağlar güçlenmiştir. Bu ürkütücü tutum en iyi Kakashi'nin gruba yaptığı "Zil Testi" ile örneklendirilebilir.
Manganın ve animenin ilk bölümünde Naruto'nun Kakashi ile arası Sasuke kadar iyi değildir. Bu olaylar esnasında Kakashi'nin sürekli Sasuke'yi çalıştırdığı görülebilir. Bu nedenle Naruto Sasuke'yi daha da kıskanmıştır. Yine de, zamanla güçlenen Naruto'nun yeni tekniklerini gören Kakashi neredeyse her seferinde mutlu olmuştur.
Manga ve animenin ikinci bölümünde ise Sasuke'nin gidişinden dolayı Kakashi, takımın geri kalanına daha çok yoğunlaşmıştır. Hatta Kakashi'nin yaptığı ikinci bir "Zil Testi" sonucunda Kakashi grubun öğretmeni değil, grubun Naruto ve Sakura gibi bir elemanı olmuştur. Ayrıca, Naruto 2,5 senelik uzun bir çalışma sonucunda Jiraiya'dan tekrar Kakashi'ye emanet edildiğinde Jiraiya Kakashi'den Naruto'nun içindeki şeytan tilkinin çakrasının oluşturduğu çakradan bir örtü sonucunda güçlendiğini fakat aynı zamanda düşünme yeteneğini yitirdiğini ve bu nedenle Naruto bu forma geçtiği her seferde kare şeklinde bir seal'ı alnına yapıştırıp çakrasını durdurarak eski haline döndürmesi gerektiğini söyledi. Bu nedenle Kakashi, Naruto'yu içindeki canavardan korumakla da yükümlüdür. Bu Kakashi için zor bir görevdir çünkü bu formda Naruto düşünme yetisini kaybettiğinden dolayı çevredeki herkese saldırabilir.
Haruno Sakura, Naruto'nun aşkıdır. Fakat Sakura Sasuke'yi sevdiğinden dolayı Naruto Sakura'yı arkadaş gibi görmeye çalışmaktadır. Buna rağmen, önceleri Sakura Naruto'dan tiksinip onu hep terslemiştir ama sonraki bölümlerde Sakura ve Naruto arada kavga etseler bile artık iyi anlaşmaya başlamışlardır. Özellikle Sasuke gittikten sonra Sakura ile Naruto daha da yakınlaşmışlardır. Fakat Sakura hala Sasuke'yi seviyordur.
Serinin ikinci bölümünde (Animede Shippuden - Mangada 245. bölüm ve sonrası) dikkat çeken noktalardan birisi de Naruto'nun Sakura'ya duyduğu duygularında birazcık olgunlaşmış olmasıdır. Ama Naruto, Sakura'nın bir Medical Ninja olarak öğrendiği yeni teknikleri (Süper kas kuvveti, iyileştirme, ilaçlar ve şifalı bitkiler hakkında bilgi sahibi olması) görünce şaşırmaktan kendini alamamıştır.
Gaara ile ilişkisi
Gaara da kendisi gibi içinde bir yaratık taşımaktadır.Bu nedenle onu kendisine benzetmektedir. Ama Naruto bu yanlızığını şakalar yaparak atmış gaara ise cinayetler işlemiştir.
